Para acessar o GNRE que Consta como reprovado pelo fiscal, basta ir em Consulta de Documentos e filtrar :

Após encontrada a DT que consta a GNRE, basta verificar o status:

Para verificar o estado que se encontra o processo de validação do Fiscal da GNRE, basta ir na 8ª bolinha (Validado pelo fiscal) e clicar na mesma.

Repare que a oitava bolinha está vermelha, indicando algum erro, também é possível visualizar no canto inferior direito que a GNRE foi reprovada pelo fiscal conforme a imagem abaixo:

Apertando no botão é possível verificar a justificativa de rejeição do documento:

Possíveis Motivos de Reprova da GNRE: 

Valor da guia gerado incorretamente

Líquida Incorreta

Documento incorreto

valores calculados incorretos

Depois de verificar o motivo de reprovação da GNRE, é preciso retirar os documentos emitidos incorretamente, para isso devemos seguir os seguintes passos:

Passo 1:

 Na consulta de documento clicar na 7ª bolinha (Comprovante do pagto recebido), e apertar no símbolo  

Irá abrir uma caixa perguntando se deseja deletar o comprovante, clique em sim conforme a imagem abaixo:

Feito isso o documento será deletado da DT.

Passo 2:

Agora será necessário realizar o cancelamento da GNRE, para isso basta clicar na sexta bolinha "GNRE Gerado/ Recebimento"

Selecione a GNRE que deseja cancelar e aperte no ícone "X" como demonstrado na imagem: 

 Aparecerá uma tela em que é necessário informar o motivo do cancelamento, depois de informado selecionar sim.

Passo 3:

 Após os processos serem realizados anteriormente, deve-se entrar no módulo de cancelamento para aprovar o cancelamento da GNRE,  para isso basta entrar em Relatórios > Consulta de cancelamento

 Filtrar o documento:

Após identificar o documento clique no botão Aprovar/Reprovar Cancelamento, conforme mostrado nas imagens abaixo:

Finalizado esse processo a GNRE já vai estar Cancelada.

Pronto, agora é só realizar o upload da GNRE com as divergências corrigidas, após o fiscal validar a DT ficará apta ao fluxo de pagamento.